工研院重視員工之健康福祉，透過每年辦理之員工健康檢查、提供優於法規之健檢項目、院區設置健保門診及藥局、建置「工研人好健康」健康資訊管理系統及每年辦理多種健康促進活動和講座，為員工規劃全面的健康管理和照護服務。各院區亦有職業醫學科專科醫師臨場服務，提供健康檢查結果諮詢、配工/復工與母性保護等適性訪談、異常工作負荷評估等服務。

2023 年舉辦員工健康促進活動共 708 場次、參與 201,735 人次。此外，本院設有心理諮詢室，提供專業心理諮詢服務和多元身心靈成長課程，讓員工身心靈都能被完整支持和照顧。

健檢資訊系統化，完善健康促進方案 

每年辦理在職員工健檢，不分年齡層均可參加。透過本院開發的「工研人好健康」管理系統分析員工健檢異常項目，健檢後安排醫師個別解說檢查結果，根據員工健檢結果設計客製化的健康促進方案。

健康餐飲-永續綠食餐飲的工研食堂

工研食堂約17櫃位、80道特色料理、葷/素兼具，特聘營養師把關，以三色托盤宣導營養等級(綠色多吃、黃色偶爾吃、紅色少吃)，推出多蔬菜、多全榖、少油炸之健康餐守護員工健康。

完善運休服務及身心靈健康講座

建造一流的運休中心-悠活館，提供溫水游泳池、健身房、羽球館、桌球、撞球、紓壓按摩及KTV等設施，並補助福利金鼓勵同仁使用。每年舉辦各類運動課程、院長盃各類體能賽、身心健康講座，涵蓋疾病預防、情感教育、生涯規劃及心靈探索等多面向，鼓勵員工學習，維持身心健康生活。

點亮身心的整合體驗

本院心理諮詢室提供舒適且兼顧隱私之無障礙晤談空間，透過專業心理支持幫助員工安頓身心，提升工作與生活品質，進而將個人生涯與本院組織發展結合，邁向共好雙贏。每位員工提供一年最多15次諮詢，於此範圍內員工直系親屬與配偶亦可使用服務，費用皆由本院負擔。